Σε ένα πολύ μακρινό μέλλον, ανακαλύφθηκε μια ψυχική ορμόνη στον ανθρώπινο εγκέφαλο, η οποία δίνει στους ανθρώπους υπεραισθητικές δυνάμεις και αλλάζει τον κόσμο όπως τον ξέρουμε.

Την ώρα που η ανθρωπότητα έμπαινε σε αυτή τη νέα εποχή, διαταραγμένοι μεταλλαγμένοι γνωστοί ως Άλλοι άρχισαν να κατεβαίνουν από τον ουρανό με δίψα για ανθρώπινα μυαλά. Ανθεκτικοί στις συμβατικές μεθόδους επίθεσης, έπρεπε να ληφθούν ακραία μέτρα για να καταπολεμηθεί η συντριπτική απειλή και να διατηρηθεί η ανθρωπότητα.

Εκείνοι με οξείες εξωαισθητικές ικανότητες, γνωστές ως ψιονικές, ήταν η ευκαιρία μας να πολεμήσουμε την επίθεση από ψηλά. Μέχρι σήμερα, οι ψιονικοί ανιχνεύονται για τα ταλέντα τους και στρατολογούνται στη Δύναμη Καταστολής Άλλων (OSF), την τελευταία γραμμή άμυνας της ανθρωπότητας.

Αναλάβετε το ρόλο του Yuito Sumeragi, ενός νεοσύλλεκτου στο OSF που έχει ως στόχο να γίνει ένας ελίτ ψιονικός σαν αυτόν που τον έσωσε όταν ήταν παιδί. Οπλισμένοι με ένα ταλέντο στην ψυχοκίνηση, εξερευνήστε τη φουτουριστική πόλη New Himuka και αποκαλύψτε τα μυστήρια ενός μέλλοντος Brain Punk ανάμεσα στην τεχνολογία και τις ψυχικές ικανότητες στο SCARLET NEXUS.